天然红辣椒中含有辣椒红色素（简称辣椒红）、辣椒素、辣椒油脂等。其中辣椒红是辣椒红素、辣椒玉红素和β――胡萝卜素等色素的混合物，为深红色油状液体；可作为食品及化妆品的天然色素使用。
辣椒素属于胺类化合物，产生辣椒特有的辣味，具有很高的医用（如镇痛）及军用（如催泪弹）价值，而且还是人们日常生活中常用的调味品。
天然红辣椒中辣椒红、辣椒素、辣椒油脂等成分的分离提纯具有极高的经济效益。